Toggle column: Linker Name PDB ID Linker Chain Amino Acid Position Amino Acid Amino Acid Atom Contact Distance Interaction Type Nucleotide Chain Nucleotide Position Nucleotide Nucleotide Atom Ligand Structurename Ligand ID
Linker Name PDB ID Linker Chain Amino Acid Position Amino Acid Amino Acid Atom Contact Distance Interaction Type Nucleotide Chain Nucleotide Position Nucleotide Nucleotide Atom Ligand Structurename Ligand ID
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL O 4.06 Å van-der-waals B 2 C C4 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER CA 3.41 Å van-der-waals B 2 C N3 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL C 4.11 Å van-der-waals B 2 C C2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL O 4.66 Å van-der-waals B 2 C C6 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG CZ 4.43 Å van-der-waals B 2 C O2' 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER OG 4.75 Å van-der-waals B 3 A C5 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER CA 4.37 Å van-der-waals B 2 C N4 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL C 4.75 Å van-der-waals B 2 C O2' 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL CA 4.82 Å van-der-waals B 2 C C4 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER CA 3.81 Å van-der-waals B 2 C O2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG CZ 4.28 Å ionic B 2 C OP2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL O 4.91 Å van-der-waals B 2 C C1' 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL C 4.03 Å van-der-waals B 2 C N3 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG NH2 4.71 Å ionic B 2 C P 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG NH2 3.36 Å van-der-waals B 2 C C2' 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL N 3.93 Å van-der-waals B 2 C C4 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL CA 4.93 Å van-der-waals B 2 C N4 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 72 HIS O 3.03 Å hbond B 2 C N4 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER OG 3.75 Å van-der-waals B 2 C C2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 75 PRO N 4.74 Å van-der-waals B 2 C O2' 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG NH2 3.83 Å ionic B 2 C OP2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG NH2 4.64 Å van-der-waals B 2 C O5' 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 75 PRO C 4.52 Å van-der-waals B 2 C O2' 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL O 4.62 Å van-der-waals B 2 C C5 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG NH2 4.43 Å van-der-waals B 2 C N3 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL CB 4.75 Å van-der-waals B 2 C N3 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER CB 3.79 Å van-der-waals B 2 C O2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL CA 4.38 Å van-der-waals B 2 C O2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL O 4.1 Å van-der-waals B 2 C O2' 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL O 3.54 Å van-der-waals B 2 C N3 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER CA 4.37 Å van-der-waals B 2 C C4 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 75 PRO CA 4 Å van-der-waals B 2 C O2' 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER C 3.99 Å van-der-waals B 2 C O2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG CZ 4.76 Å van-der-waals B 2 C N1 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG NH2 3.39 Å van-der-waals B 2 C C6 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG CZ 4.67 Å van-der-waals B 2 C C2' 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG CZ 4.39 Å van-der-waals B 2 C C5 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 76 LYS N 4.09 Å van-der-waals B 2 C O2' 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL C 4.79 Å van-der-waals B 2 C C4 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG NH2 4.05 Å van-der-waals B 2 C C1' 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL CA 4.52 Å van-der-waals B 2 C C2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG CZ 4.83 Å van-der-waals B 2 C C4 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL N 3.63 Å van-der-waals B 2 C C2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 75 PRO N 4.44 Å van-der-waals B 2 C O2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER CB 4.19 Å van-der-waals B 2 C N3 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER N 4.41 Å van-der-waals B 2 C N3 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 72 HIS C 4.51 Å van-der-waals B 2 C N3 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER OG 3.95 Å van-der-waals B 2 C N3 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 75 PRO N 4.87 Å van-der-waals B 2 C C2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL C 4.95 Å van-der-waals B 2 C N1 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL C 3.96 Å van-der-waals B 2 C O2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 72 HIS O 3.88 Å van-der-waals B 2 C C4 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG NH1 4.99 Å van-der-waals B 2 C C6 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 72 HIS O 3.77 Å van-der-waals B 2 C N3 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL N 3.02 Å hbond B 2 C N3 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER N 4.71 Å van-der-waals B 2 C N4 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER C 4.68 Å van-der-waals B 2 C C4 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL N 4.9 Å van-der-waals B 2 C N1 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER OG 4.55 Å van-der-waals B 3 A N7 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER CB 4.19 Å van-der-waals B 3 A N6 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG NH1 3.78 Å hbond B 2 C OP2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG 4.06 Å stack B 2 C 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL O 4.61 Å van-der-waals B 2 C N4 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER O 4.93 Å van-der-waals B 2 C N3 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG NH2 4.26 Å van-der-waals B 2 C C4 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG NE 4.97 Å van-der-waals B 2 C C4 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 75 PRO CB 4.97 Å van-der-waals B 2 C O2' 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL N 4.04 Å van-der-waals B 2 C N4 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG NH2 3.19 Å hbond B 2 C O2' 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL O 4.2 Å van-der-waals B 2 C N1 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER C 4.31 Å van-der-waals B 2 C C2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG NE 4.89 Å van-der-waals B 2 C C5 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL O 3.61 Å van-der-waals B 2 C C2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG NH2 4.14 Å van-der-waals B 2 C C2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER OG 2.82 Å hbond B 2 C O2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL N 3.51 Å van-der-waals B 2 C O2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER CA 4.06 Å van-der-waals B 2 C C2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG NH2 4.72 Å van-der-waals B 2 C C3' 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 72 HIS C 4.15 Å van-der-waals B 2 C N4 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL O 4.86 Å van-der-waals B 2 C C2' 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER OG 4.31 Å van-der-waals B 3 A C6 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG NH2 3.6 Å van-der-waals B 2 C N1 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG CZ 4.36 Å van-der-waals B 2 C C6 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 72 HIS C 4.85 Å van-der-waals B 2 C C4 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER OG 3.3 Å hbond B 3 A N6 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG NH2 3.75 Å van-der-waals B 2 C C5 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 71 GLU CB 4.16 Å van-der-waals B 2 C N4 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL CA 4.06 Å van-der-waals B 2 C N3 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER CB 4.41 Å van-der-waals B 2 C C2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 75 PRO CA 4.87 Å van-der-waals B 2 C O2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 79 ARG NH2 4.84 Å van-der-waals B 2 C O2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER C 4.69 Å van-der-waals B 2 C N4 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 73 SER C 3.7 Å van-der-waals B 2 C N3 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL O 3.79 Å van-der-waals B 2 C O2 6GX6B00 Lig75
O00425_linker1 6GX6 A 74 VAL CB 4.9 Å van-der-waals B 2 C N4 6GX6B00 Lig75