Linker Name | PDB ID | Linker Chain | Amino Acid Position | Amino Acid | Amino Acid Atom | Contact Distance | Interaction Type | Nucleotide Chain | Nucleotide Position | Nucleotide | Nucleotide Atom | Ligand Structurename | Ligand ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 99 | SER | OG | 4.29 Å | van-der-waals | C | 10 | U | P | 4ED5C00 | Lig72 |
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Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 98 | PRO | O | 4.08 Å | van-der-waals | C | 9 | U | O2 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 97 | ARG | CA | 3.65 Å | van-der-waals | C | 9 | U | O4 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 104 | LYS | CD | 4.83 Å | van-der-waals | C | 9 | U | O3' | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 104 | LYS | CE | 4.09 Å | ionic | C | 10 | U | OP2 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 98 | PRO | C | 3.84 Å | van-der-waals | C | 9 | U | O2 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 104 | LYS | CD | 4.13 Å | van-der-waals | C | 9 | U | C3' | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 103 | ILE | CD1 | 3.78 Å | van-der-waals | C | 9 | U | N3 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 94 | SER | OG | 4.58 Å | van-der-waals | C | 8 | U | N3 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 98 | PRO | O | 4.43 Å | van-der-waals | C | 9 | U | N3 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 99 | SER | N | 4.26 Å | van-der-waals | C | 9 | U | C2 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 107 | ASN | CG | 4.86 Å | van-der-waals | C | 4 | U | C4 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 97 | ARG | N | 4.92 Å | van-der-waals | C | 9 | U | C5 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 97 | ARG | CZ | 4.24 Å | van-der-waals | C | 9 | U | C5 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 97 | ARG | CB | 3.54 Å | van-der-waals | C | 9 | U | O4 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 97 | ARG | CG | 3.81 Å | van-der-waals | C | 9 | U | O4 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 97 | ARG | NH1 | 4.56 Å | van-der-waals | C | 8 | U | C1' | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 95 | TYR | C | 4.99 Å | van-der-waals | C | 9 | U | O4 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 104 | LYS | C | 4.99 Å | van-der-waals | C | 9 | U | P | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 103 | ILE | CD1 | 4.69 Å | van-der-waals | C | 9 | U | O4 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 99 | SER | CB | 3.25 Å | van-der-waals | C | 9 | U | O2 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 99 | SER | CB | 4.94 Å | van-der-waals | C | 10 | U | C6 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 96 | ALA | CB | 4.46 Å | van-der-waals | C | 9 | U | C4 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 99 | SER | C | 4.58 Å | van-der-waals | C | 9 | U | O2 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 96 | ALA | CB | 4.2 Å | van-der-waals | C | 9 | U | N3 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 104 | LYS | CA | 3.38 Å | van-der-waals | C | 9 | U | OP2 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 96 | ALA | C | 3.61 Å | van-der-waals | C | 9 | U | O4 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 96 | ALA | C | 4.36 Å | van-der-waals | C | 9 | U | C4 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 104 | LYS | NZ | 4.72 Å | van-der-waals | C | 9 | U | C3' | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 97 | ARG | NH1 | 3.71 Å | van-der-waals | C | 8 | U | C2 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 99 | SER | OG | 4.11 Å | van-der-waals | C | 9 | U | C3' | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 97 | ARG | CD | 4.84 Å | van-der-waals | C | 9 | U | C4 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 97 | ARG | CG | 4.71 Å | van-der-waals | C | 9 | U | C4 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 100 | SER | C | 4.3 Å | van-der-waals | C | 9 | U | O2' | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 104 | LYS | CB | 4.83 Å | ionic | C | 9 | U | P | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 104 | LYS | CG | 4.12 Å | van-der-waals | C | 9 | U | C3' | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 97 | ARG | NE | 3.93 Å | van-der-waals | C | 9 | U | C4 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 99 | SER | CB | 3.44 Å | van-der-waals | C | 9 | U | O2' | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 99 | SER | OG | 4.87 Å | van-der-waals | C | 10 | U | C6 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 103 | ILE | CD1 | 3.74 Å | van-der-waals | C | 9 | U | C6 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 97 | ARG | N | 3.46 Å | van-der-waals | C | 9 | U | N3 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 97 | ARG | NE | 4.88 Å | van-der-waals | C | 9 | U | N3 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 104 | LYS | CG | 4.29 Å | ionic | C | 9 | U | OP2 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 97 | ARG | CB | 4.18 Å | van-der-waals | C | 9 | U | N3 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 97 | ARG | O | 3.3 Å | van-der-waals | C | 9 | U | C2 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 104 | LYS | CB | 4.11 Å | ionic | C | 9 | U | OP2 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 99 | SER | CA | 3.15 Å | van-der-waals | C | 9 | U | O2 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 97 | ARG | NH1 | 4.46 Å | van-der-waals | C | 8 | U | N1 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 99 | SER | CA | 4.73 Å | van-der-waals | C | 9 | U | N1 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 97 | ARG | NE | 4.42 Å | van-der-waals | C | 9 | U | C5 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 94 | SER | OG | 4.92 Å | van-der-waals | C | 8 | U | O4 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 104 | LYS | NZ | 4.66 Å | van-der-waals | C | 9 | U | O3' | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 104 | LYS | CD | 4.15 Å | ionic | C | 10 | U | OP1 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 97 | ARG | NH1 | 4.59 Å | van-der-waals | C | 9 | U | C6 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 103 | ILE | CG1 | 4.8 Å | van-der-waals | C | 9 | U | N1 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 97 | ARG | CD | 4.06 Å | van-der-waals | C | 9 | U | O4 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 99 | SER | CA | 4.67 Å | van-der-waals | C | 9 | U | C1' | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 96 | ALA | CA | 3.53 Å | van-der-waals | C | 9 | U | O4 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 103 | ILE | CD1 | 3.63 Å | van-der-waals | C | 9 | U | C2 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 97 | ARG | N | 2.75 Å | hbond | C | 9 | U | O4 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 103 | ILE | CG1 | 4.84 Å | van-der-waals | C | 9 | U | C6 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 104 | LYS | CG | 4.89 Å | van-der-waals | C | 9 | U | C5' | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 97 | ARG | NH1 | 4.66 Å | van-der-waals | C | 8 | U | C2' | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 104 | LYS | N | 4.25 Å | van-der-waals | C | 9 | U | OP2 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 99 | SER | CA | 3.36 Å | van-der-waals | C | 9 | U | O2' | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 100 | SER | N | 4.98 Å | van-der-waals | C | 9 | U | O2 | 4ED5C00 | Lig72 |
Q15717_linker1 | 4ED5 | B | 99 | SER | OG | 4.82 Å | van-der-waals | C | 9 | U | N1 | 4ED5C00 | Lig72 |