Lig121

Ligand information

  • Ligand ID: Lig121
  • Ligand Type : RNA
  • Ligand Length : 12
  • Ligand Sequence : GUGUGAAUGAAU

Available Structures for this Ligand- 1

Ligand Structurename PDB ID Chain ID
4BS2B00 4BS2 B

Binding Information from Structures

Experiment ID RRM Structure RRM Entryename Experiment Type Ligand ID Contacts
Exp_4BS2 4BS2A01 Q13148_RRM1 NMR Lig121 Contacts
Exp_4BS2 4BS2A02 Q13148_RRM2 NMR Lig121 Contacts

Binding Experiments for this domain - 30 

Experiment ID RRM Entryname Experiment Type Ligand ID Binds? Binding Affinity
Exp_311 Q13148_RRM2 ITC Lig121 Yes 26.9 ± 4.3 nM
Exp_311 Q13148_RRM1 ITC Lig121 Yes 26.9 ± 4.3 nM
Exp_315 Q13148_RRM2 ITC Lig121 Yes 85.5 ± 14.8 nM
Exp_315 Q13148_RRM1 ITC Lig121 Yes 85.5 ± 14.8 nM
Exp_316 Q13148_RRM2 ITC Lig121 Yes 529.1 ± 26.1 nM
Exp_316 Q13148_RRM1 ITC Lig121 Yes 529.1 ± 26.1 nM
Exp_317 Q13148_RRM2 ITC Lig121 Yes 155.8 ± 9.6 nM
Exp_317 Q13148_RRM1 ITC Lig121 Yes 155.8 ± 9.6 nM
Exp_318 Q13148_RRM2 ITC Lig121 Yes 393.7 ± 15.8 nM
Exp_318 Q13148_RRM1 ITC Lig121 Yes 393.7 ± 15.8 nM
Exp_319 Q13148_RRM2 ITC Lig121 Yes 471.7 ± 36.5 nM
Exp_319 Q13148_RRM1 ITC Lig121 Yes 471.7 ± 36.5 nM
Exp_320 Q13148_RRM2 ITC Lig121 Yes 109.4 ± 13.4 nM
Exp_320 Q13148_RRM1 ITC Lig121 Yes 109.4 ± 13.4 nM
Exp_321 Q13148_RRM2 ITC Lig121 Yes 27.5 ± 4.3 nM
Exp_321 Q13148_RRM1 ITC Lig121 Yes 27.5 ± 4.3 nM
Exp_322 Q13148_RRM2 ITC Lig121 Yes 122.1 ± 8.3 nM
Exp_322 Q13148_RRM1 ITC Lig121 Yes 122.1 ± 8.3 nM
Exp_323 Q13148_RRM2 ITC Lig121 Yes 35.6 ± 7.9 nM
Exp_323 Q13148_RRM1 ITC Lig121 Yes 35.6 ± 7.9 nM
Exp_324 Q13148_RRM2 ITC Lig121 Yes 64.9 ± 9.2 nM
Exp_324 Q13148_RRM1 ITC Lig121 Yes 64.9 ± 9.2 nM
Exp_325 Q13148_RRM2 ITC Lig121 Yes 28.8 ± 3.4 nM
Exp_325 Q13148_RRM1 ITC Lig121 Yes 28.8 ± 3.4 nM
Exp_326 Q13148_RRM2 ITC Lig121 Yes 1000 ± nM
Exp_326 Q13148_RRM1 ITC Lig121 Yes 1000 ± nM
Exp_327 Q13148_RRM2 ITC Lig121 Yes 191.9 ± 21.7 nM
Exp_327 Q13148_RRM1 ITC Lig121 Yes 191.9 ± 21.7 nM
Exp_328 Q13148_RRM2 ITC Lig121 Yes 66.7 ± 7.9 nM
Exp_328 Q13148_RRM1 ITC Lig121 Yes 66.7 ± 7.9 nM

RRM domains tested for Binding - 2 

RRM Entryname Sequence Range RRM Sequence
Q13148_RRM1 106 - 172 LIVLGLPWKTTEQDLKEYFSTFGEVLMVQVKKDLKTGHSKGFGFVRFTEYETQVKVMSQRHMIDGRW
Q13148_RRM2 193 - 243 VFVGRCTEDMTEDELREFFSQYGDVMDVFIPKPFRAFAFVTFADDQIAQSL